Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myo3bQ1EG27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myo3bQ1EG27 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms