Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtel1Q0VGM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtel1Q0VGM9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms