Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpne7Q0VE82 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpne7Q0VE82 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms