Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc1Q0VDN7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms