Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
StumQ0VBF8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms