Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TrioQ0KL02 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TrioQ0KL02 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms