Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kndc1Q0KK55 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms