Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc21bQ0HA38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc21bQ0HA38 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms