Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnnm1Q0GA42 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnnm1Q0GA42 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms