Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gata4Q08369 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gata4Q08369 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms