Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calb2Q08331 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms