Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou6f1Q07916 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou6f1Q07916 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms