Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ebf1Q07802 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms