Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NrepQ07475 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NrepQ07475 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms