Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdx4Q07424 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdx4Q07424 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms