Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn3Q07409 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn3Q07409 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms