Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39Q06138 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms