Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPINDOCQ05AH6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPINDOCQ05AH6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms