Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fmn1Q05860 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fmn1Q05860 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms