Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smpd1Q04519 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smpd1Q04519 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms