Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RelaQ04207 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms