Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnd1Q03719 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms