Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnb1Q03717 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnb1Q03717 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms