Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms