Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fgfr4Q03142 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms