Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1sQ02789 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1sQ02789 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms