Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col6a2Q02788 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms