Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp39Q02525 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp39Q02525 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms