Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms