Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl1Q02067 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms