Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VcpQ01853 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VcpQ01853 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VcpQ01853 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms