Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd1Q01822 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd1Q01822 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms