Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mc1rQ01727 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mc1rQ01727 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms