Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb2Q00977 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb2Q00977 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms