Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms