Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd80Q00609 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd80Q00609 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms