Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms