Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms