Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shc1P98083 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shc1P98083 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms