Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Brca2P97929 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms