Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlkP97793 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlkP97793 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlkP97793 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlkP97793 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlkP97793 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AlkP97793 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlkP97793 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlkP97793 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms