Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cry1P97784 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cry1P97784 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms