Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx3-2P97503 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms