Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Smarcc1P97496 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms