Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bop1P97452 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms