Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Meis3P97368 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms