Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RptnP97347 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RptnP97347 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RptnP97347 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RptnP97347 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RptnP97347 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RptnP97347 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RptnP97347 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RptnP97347 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RptnP97347 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RptnP97347 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms