Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H3f3aP84244 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3f3aP84244 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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