Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbx1P82976 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms