Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr4P70658 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms